generell

• wo findet die zyklisierung statt?
• ist position konserviert? oder unterschiede zwischen spezies?
• passt lokalisierung mit wissen aus literatur? (benachbarte strukturelemente, bekannte stellen, ...)

subopts

• gibt es alternative stabile interaktionsstellen?
• passt deren position ggf. besser zu der anderer spezies?

5'utr structure change

• kann man mit interaktionen ggf. strukturänderungen am 5' ende erklären?